El antagonismo microbiano es el método de usar cultivos establecidos de microorganismos para prevenir la intrusión de cepas extrañas. Cuando se introduce en un entorno ya colonizado, una cepa invasiva de bacterias tiende a no prosperar y puede ir completamente extinto.
Un ejemplo de antagonismo microbiano en el cuerpo humano es la resistencia de las bacterias bucales establecidas a nuevas cepas que pueden introducirse a través del contacto boca a boca. Después de un beso, por ejemplo, se introducen nuevas bacterias en el ambiente hostil de una boca extraña. Una vez allí, el crecimiento de las bacterias invasoras se inhibe por los compuestos antimicrobianos secretados por la flora nativa, así como por la fuerte competencia por los recursos.
