La zona crepuscular, también llamada zona mesopelágica, es el hogar de muchas especies de calamares y pulpos, así como de algunos peces bioluminiscentes, incluidos los peces hacha. Algunos animales similares a las medusas llamados ctenóforos y sifonóforos también viven en la zona.
La zona del crepúsculo no tiene vida vegetal porque la oscuridad del agua evita la fotosíntesis. Los animales que viven allí deben ser lo suficientemente fuertes para soportar temperaturas más frías y una mayor presión del agua que los animales que viven más cerca de la superficie. Los peces de la zona del crepúsculo, incluidos los peces viper y dragonfish, tienden a tener cuerpos más pesados porque, a diferencia de los peces de superficie, no necesitan nadar rápidamente. A menudo tienen grandes dientes y bocas porque sus presas pueden ser más grandes de lo que son.
Algunos animales viajan en aguas menos profundas a veces. Estos incluyen peces más grandes, tales como pez espada, tiburones de cadena y sepia. En la zona mesopelágica también se pueden encontrar varios tipos de anguilas, incluidas las anguilas lobo y las anguilas snipe. Algunos herbívoros pueden aventurarse en la zona mesopelágica a veces, pero no permanecen allí debido a la falta de alimentos. Los animales que viven allí la mayor parte del tiempo son carnívoros o animales que sobreviven con desechos, como bolitas fecales y organismos muertos, que se hunden en la zona del crepúsculo. Estos animales se llaman detritívoros.