La diferencia entre protoplasma y citoplasma es que la primera abarca el citoplasma y el núcleo de una célula, mientras que el citoplasma es la sustancia semifluida que se encuentra debajo de la membrana de la célula. Esto significa que la diferencia es menor , ya que ambos términos pueden referirse a aproximadamente los mismos componentes de una celda con diferentes niveles de precisión.
Protoplasma es una palabra que se ha ido dejando de usar en la biología moderna debido a su origen en gran parte inexacto. Hoy en día, se refiere solo al citoplasma y al núcleo en lugar de dar a entender que las células eran solo recipientes de protoplasma. Desde entonces, la ciencia moderna ha descubierto que las células son mucho más complejas.
El citoplasma es la sustancia que contiene los orgánulos de las células que tienen un núcleo, que rodea a los orgánulos como las mitocondrias, el aparato de Golgi y el citoesqueleto. Todos estos componentes forman parte de una célula de la misma manera que los organismos grandes tienen órganos, que realizan funciones vitales para la supervivencia de la célula. Por ejemplo, las mitocondrias producen energía en forma de trifosfato de adenosina para el uso de la célula, el citoesqueleto mantiene la forma y la estructura de la célula, y el aparato de Golgi modifica, empaqueta y clasifica las proteínas para transportarlas a sus destinos celulares más adelante.