La expedición española que Balboa se unió a América del Sur consistió en dos barcos, Santa María y San Antón. Balboa realizó otras expediciones, pero los nombres de los barcos son inciertos.
La expedición española a la que Balboa se unió en 1501 reunió un tesoro, pero las dos naves se hundieron en 1503 debido al daño causado previamente por los gusanos teredo. Las naves estaban demasiado dañadas y no pudieron sobrevivir a la tormenta, por lo que se hundieron, y parte del tesoro que habían recogido se perdió. Durante una expedición posterior, Balboa navegó en un barco llamado Rolling Wind, pero el año de esa expedición es incierto.
