Las semillas de manzana se dispersan en la naturaleza a través de zoochory, o cuando son transportadas por animales. Los animales comen la fruta y se llevan las semillas en su tracto digestivo. Cuando la semilla pasa por las heces del animal, la semilla brota y propaga un manzano nuevo.
Los manzanos cultivados se propagan asexualmente a través de injertos. Los agricultores hacen esto para mantener las variedades de manzana consistentes dentro de un huerto. Debido a que cada semilla de manzana contiene una combinación única de ADN, no hay dos semillas del mismo árbol o incluso dentro de la misma manzana que producen árboles idénticos. Los diferentes tamaños de rizoma utilizados en un injerto producen diferentes tamaños de manzanos, que producen frutos a diferentes tasas.
