La eutrofización de un ecosistema acuático puede reducirse o revertirse al disminuir la adición de nutrientes al sistema. Las fuentes de exceso de nutrientes pueden bloquearse físicamente para que no entren al ecosistema afectado. Alternativamente, estas fuentes pueden tratarse para eliminar nutrientes en un punto aguas arriba del ecosistema afectado.
Los cuerpos de agua se vuelven eutróficos debido a un aumento en los nutrientes disponibles, generalmente fósforo y nitrógeno. Algunas corrientes de desechos con alto contenido de nutrientes entran accidentalmente en lagos y ríos; otros son abandonados deliberadamente como un medio para deshacerse de materiales no deseados. Las fuentes comunes de nutrientes son el estiércol agrícola y la escorrentía de fertilizantes y el efluente de aguas residuales municipales.
Las prácticas agrícolas, como la reducción de la labranza, la aplicación reducida de fertilizantes y el cultivo de cobertura, ayudan a minimizar la cantidad de escurrimiento de fertilizante que se produce. Las cercas y las zonas de amortiguamiento vegetativo evitan que los fertilizantes solubles en agua y en el suelo salgan de los campos agrícolas y entren en lagos y arroyos. Las fuentes de estiércol agrícola que están contenidas, tratadas y manejadas adecuadamente y que no fluyen directamente a los lagos y ríos ayudan a prevenir la eutrofización. También es importante que se evite que el ganado y otros animales pasten cerca de arroyos y ríos o que caminen por ellos. Un propietario privado puede reducir la cantidad de fertilizante para césped que usa y usar productos para el cuidado del césped con bajo contenido de fosfato.
