El peróxido de hidrógeno se descompondrá naturalmente en agua y oxígeno cuando se exponga a la luz solar, pero también puede volverse inerte agregando ácido oxálico, carbón activo o muchos otros ácidos suaves. El peróxido de hidrógeno es más básico que ácido, por lo que si es necesario neutralizarlo más rápido de lo que se neutralizaría automáticamente con la luz solar, se debe agregar algún tipo de ácido para acercar su valor de pH a 7.
La solución estándar de peróxido de hidrógeno que se puede comprar en la tienda es en realidad solo un 3 por ciento de peróxido de hidrógeno y el resto es agua. Esta solución es una base muy suave que no causará ningún daño. Se vende en una botella opaca porque se descompondrá muy rápidamente cuando se exponga a la luz solar. Si es necesario desechar esta solución, simplemente se puede verter por el desagüe debido a la suavidad de la base.
Algunas soluciones de peróxido de hidrógeno pueden contener hasta un 30 por ciento de peróxido de hidrógeno. Estas soluciones deben manejarse con cuidado y deben desecharse de manera adecuada, y definitivamente no deben verterse en el desagüe. La solución se puede diluir con agua y dejar que se descomponga naturalmente, o se puede neutralizar agregando ciertos ácidos como el ácido oxálico o el carbón activo. Cabe señalar que la neutralización con un ácido producirá una reacción exotérmica, lo que significa que producirá calor.