La fisión binaria es el proceso principal mediante el cual las bacterias se reproducen asexualmente. Puede resumirse como un proceso en el que la célula se agranda, su ADN se replica y la célula se divide en dos células, cada una con una. Copia del ADN. Las bacterias generalmente solo se someten a fisión binaria en circunstancias favorables.
La fisión binaria implica el uso de maquinaria celular para mover el ADN replicado a los lados opuestos de la célula y luego dividir la célula en dos. Múltiples unidades de un tipo especial de anillo se ensamblan en el centro de la célula divisoria, y éstas luego comienzan a contraerse, pellizcando la membrana celular cerrada entre cada célula hija. Otra maquinaria celular garantiza que el ADN no se dañe ya que la membrana celular se contrae. En muchos tipos de bacterias, también se construye una nueva pared celular entre las células hijas, ya que la membrana celular está cerrada por compresión.
Si bien la fisión binaria es la forma más común de reproducción para las bacterias, no es el único método utilizado. Algunas especies de bacterias fotosintéticas en cambio crecen a un tamaño muy grande y luego se dividen varias veces en una capa redonda antes de dispersarse. Otras especies se ramifican y se reproducen por brotes, formando células hijas mucho más pequeñas en lugar de dos células hijas iguales de una célula en división.