Los cuerpos de agua afectados por la lluvia ácida incluyen los arroyos y lagos que rodean las montañas Adirondacks y Catskill, las tierras altas de la región media de los Apalaches y el Medio Oeste. Una encuesta realizada por la Agencia de Protección Ambiental indica que más del 75 por ciento de los 1,000 cuerpos de agua dulce más grandes que 10 acres están acidificados.
La situación es particularmente grave en áreas donde la capacidad de amortiguación del suelo es pobre, ya que esto conduce a la acumulación de acidez del suelo cuando la lluvia ácida cae continuamente. Little Echo Pond en Franklin, N.Y., es un buen ejemplo, registrando un pH de 4.2. Las corrientes que fluyen a través de regiones con una baja capacidad de amortiguación del suelo absorben la acidez del suelo, ganando su propia acidez. Otras fuentes de acidez de la corriente incluyen la escorrentía ácida de los diluvios y el derretimiento de la nieve.
La lluvia ácida también causa problemas ecológicos, incluida la reducción de la población de peces debido a la erradicación de huevas y alevines. La lluvia ácida frena el crecimiento de los árboles y altera el equilibrio ecológico de los biomas forestales. La velocidad de liberación de iones de metales, como el aluminio, en el ecosistema se acelera en un ambiente ácido. Estos iones metálicos son tóxicos y causan grandes daños a los peces y animales acuáticos. La destrucción de la vida vegetal y animal debido a la lluvia ácida produce un efecto de cascada, en el que la biodiversidad del ecosistema comprometido causa sus propias complicaciones.
