El orgánulo que modifica y empaqueta las proteínas es el aparato de Golgi. Este orgánulo comprende varios sacos aplanados llamados cisternas. El aparato de Golgi, también llamado cuerpo de Golgi o complejo de Golgi, tiene dos lados o caras, la cara cis y la cara trans, como se describe en "La célula: un enfoque molecular".
El aparato de Golgi recupera proteínas transportadas en vesículas hechas en el retículo endoplásmico. El organelo luego modifica estas proteínas cortando algunas secciones o agregando las moléculas necesarias. Luego, una vesícula se forma alrededor de la proteína, se aplasta del aparato de Golgi y viaja hasta donde se necesita la proteína. La cara cis del aparato de Golgi se encuentra cerca del retículo endoplásmico para recibir sus productos. La cara trans del orgánulo se coloca cerca de la membrana plasmática, lista para transportar la proteína terminada fuera de la célula.
