Los zorros Fennec son presa de chacales y águilas grandes, como el búho real. Aunque aún no se ha comprobado, otros animales que se cree que comen zorros hennec incluyen hienas, caracales y perros domésticos locales.
Los científicos saben muy poco acerca de las vidas y la ecología de los zorros Fennec, por lo que el número total de depredadores que se alimentan de los zorros sigue siendo desconocido. Los estudios han demostrado que los zorros fennec son rápidos y ágiles, lo que los hace difíciles de atrapar. El comportamiento nocturno del zorro y las adaptaciones fisiológicas al duro hábitat del desierto, como las orejas grandes, el pelaje color arena y la capacidad de sobrevivir sin agua durante largos períodos de tiempo, aumentan aún más las posibilidades de que los zorros sobrevivan a los depredadores.