La Era Paleozoica, que marcó la aparición de casi todos los filos animales en unos pocos millones de años, terminó con una extinción masiva. La extinción masiva fue el opuesto virtual de lo que comenzó la era, Más del 90 por ciento de la vida del mundo ha sido eliminada. La recuperación de esta extinción en masa tomó casi 30 millones de años.
Hay muchas subsecciones en la Era Paleozoica, que dividen los millones de años en trozos más pequeños. El final de la era Paleozoica se llama la era Pérmica. Esta era vio numerosos cambios climáticos junto con las fluctuaciones en los niveles de dióxido de carbono y oxígeno. Existen numerosas hipótesis acerca de qué causó la extinción al final de la era Pérmica, incluido el mar de descarga de sulfato de hidrógeno, un gran meteoro en la Antártida o incluso todas las posibilidades combinadas en una.