Las células vegetales de un bulbo de cebolla carecen de cloroplastos porque esta parte de la planta crece por debajo del suelo, lo que la hace incapaz de absorber la luz necesaria para la fotosíntesis. La mayoría de las estructuras de raíces y bulbos subterráneas en las plantas no tienen cloroplastos por este motivo.
Aunque las células en la parte superior del bulbo que se asoman a través del suelo pueden desarrollar cloroplastos, la función principal de estas células es proteger a la planta contra patógenos dañinos en el suelo y almacenar energía. Estas funciones son posibles gracias a la pared celular, la membrana celular, el citoplasma, el núcleo y el gran vacío de la célula.
La microscopía de luz hace visible el núcleo de una célula de cebolla en el borde del citoplasma. La vacuola es visible en el centro de la célula. Esta vacuola es transparente en las células de las cebollas blancas, haciéndolas invisibles a la microscopía de luz a menos que estén teñidas. Las células de las cebollas rojas están naturalmente pigmentadas y no requieren la adición de un agente de tinción.
Las mejores muestras para ver a través de un microscopio de luz se preparan a partir de rodajas finas de cebollas pequeñas y firmes. La orientación de las células bajo un microscopio de luz puede aumentar o disminuir su visibilidad. Cuanta más luz se permita pasar, mejor será la resolución.