Los pingüinos están en peligro de extinción debido a las operaciones de pesca a gran escala que disminuyen su suministro de alimentos, los cazadores furtivos que roban sus huevos y matan a los adultos por su petróleo y los derrames de petróleo que contaminan su entorno y matan a miles de pingüinos a la vez. Las poblaciones de pingüinos también están amenazadas por el cambio climático a medida que el hielo marino se derrite, eliminando sus áreas de alimentación y criaderos.
El cambio climático es la mayor amenaza para la supervivencia de los pingüinos y la más difícil de contrarrestar; Los pingüinos están protegidos contra daños en virtud de la Ley de Especies en Peligro de 1973 y son rescatados por grupos ambientales durante los derrames de petróleo, pero su hábitat en disminución y la disminución de los suministros de alimentos hacen que les sea difícil reproducirse o prosperar. Incluso los pingüinos fuera de la Antártida están amenazados por el cambio climático. Los pingüinos africanos se alimentan de sardinas y anchoas que siguen las corrientes de las islas pequeñas, pero el cambio climático está causando que las corrientes se alejen más de las casas de los pingüinos y de sus territorios.
Los pingüinos también están amenazados por las expediciones de pesca comercial. Mientras que algunos pescadores participan en los esfuerzos de conservación y amamantan a los animales heridos, los pingüinos aún tienen que competir con los humanos por los alimentos. Los pingüinos también enfrentan amenazas de sus depredadores naturales: tiburones, orcas, leones marinos y focas leopardo.