La electroforesis se usa en el ADN para las huellas dactilares para pruebas forenses, pruebas de paternidad, verificación de reacciones de PCR, detección de enfermedades y para buscar relaciones evolutivas entre organismos. Una solución de moléculas de ADN cargadas negativamente se extrae a través del gel utilizando un campo eléctrico. Las moléculas de ADN más pequeñas se extraen a través del gel más rápido que las moléculas de ADN más grandes. Esto crea una serie de bandas que contienen moléculas de ADN de diferentes tamaños. Las bandas que están lejos del inicio del gel son las que contienen los fragmentos de ADN más pequeños, mientras que las bandas que contienen los fragmentos de ADN más grandes están situadas más cerca del inicio del gel.
Se utiliza una variedad de geles de electroforesis para determinar la información proporcionada por las proteínas, y el tipo de gel que se usa está determinado por la información que se necesita. Las proteínas contienen una variedad de aminoácidos que actúan como bloques de construcción para la estructura de las proteínas. La cantidad de aminoácidos que contienen las proteínas y las modificaciones químicas que se adjuntan a las proteínas determinan su tamaño. Las proteínas también tienen diferentes cargas según el tipo de proteína en cuestión.