Algunas especies de murciélagos hibernan, y otras están activas todo el año. Los murciélagos que viven en áreas donde los insectos se extinguen durante el invierno tienden a hibernar debido al agotamiento de las fuentes de alimentación, y los murciélagos en áreas tropicales con Las presas fiables durante todo el año no suelen hibernar.
Los murciélagos se enrollan en bolas mientras hibernan, y generalmente hibernan en las paredes o en los techos de las cuevas. Algunas especies de murciélagos hibernan hasta por seis meses, subsistiendo con solo unos pocos gramos de reservas de grasa. Su capacidad para bajar la temperatura de su cuerpo y disminuir su metabolismo y ritmo cardíaco les permite hibernar durante tanto tiempo. Los murciélagos suelen perder aproximadamente la mitad de su peso corporal total durante la hibernación.