Los coyotes no son depredadores y tienen enemigos. Los lobos a menudo expulsan o matan a los coyotes que invaden su territorio, por lo que los coyotes tienden a evitar las áreas donde viven los lobos. Los granjeros y rancheros a menudo consideran a los coyotes como una molestia y exterminan activamente a los coyotes, y algunas personas cazan coyotes para recreación.
Históricamente, los coyotes evitarían las áreas donde vivían las manadas de lobos. Sin embargo, desde la aniquilación de los lobos en la mayor parte de su rango histórico, los coyotes han ampliado enormemente su rango. Los coyotes ahora se encuentran con más frecuencia en áreas boscosas y montañosas, mientras que anteriormente, estas regiones estaban dominadas por lobos. Los coyotes también se han expandido en áreas más urbanas, donde se alimentan de basura y mascotas.