Los cocodrilos viven en vías fluviales tranquilas y poco profundas, como ríos o pantanos, en climas tropicales de Asia, África, Australia y las Américas. Algunas especies de cocodrilos prefieren los hábitats de agua salada, mientras que otras prefieren el agua dulce.
Los cocodrilos americanos y de Morelet, que se encuentran en las regiones del Caribe de América del Norte y Central, se pueden encontrar principalmente en ríos y pantanos, tanto en agua salada como en agua dulce. Los cocodrilos americanos se pueden encontrar tan al norte como al sur de la Florida.
Los cocodrilos africanos, como el cocodrilo de hocico delgado y el cocodrilo del Nilo, tienden a preferir los ríos protegidos, los manglares y los pantanos de agua dulce. El cocodrilo del Nilo también se encuentra en África subsahariana y Madagascar.