La fermentación tiene lugar en el citoplasma de la célula. En las células procariotas, todos los procesos metabólicos tienen lugar en el citoplasma; En las células eucariotas, solo la fermentación tiene lugar en el citoplasma. Otras formas de respiración en los eucariotas tienen lugar en las mitocondrias.
En las células eucariotas, la fermentación generalmente ocurre en ausencia de oxígeno. Las levaduras, que utilizan la fermentación incluso en ambientes donde hay oxígeno disponible, son la excepción a esta regla. Los procesos metabólicos en las mitocondrias requieren oxígeno, por lo que la fermentación se produce en el citoplasma.
En las levaduras, la fermentación produce etanol. Las células animales y los procariotas que utilizan la fermentación producen ácido láctico. En los animales, la fermentación con ácido láctico es un proceso de repliegue que se utiliza en las células musculares cuando el oxígeno no está disponible. Este tipo de fermentación solo se produce en las células musculares de los mamíferos.
Las bacterias productoras de ácido láctico se utilizan en la producción de alimentos fermentados. Estos incluyen yogur, chucrut, kimchi y algunos tipos de cerveza agria. Otras cervezas y vinos se producen con fermentación de levadura que produce etanol. La masa del pan se levanta a través de la fermentación de la levadura; El dióxido de carbono producido como producto de desecho forma las burbujas que dan a la masa su estructura. Industrialmente, la fermentación se utiliza para producir biocombustibles, en la producción de hidrógeno y para tratar los desechos humanos en plantas de tratamiento de agua.