Chlamydia trachomatis se descubrió por primera vez en los ojos de los orangutanes de la isla de Java. Durante las expediciones para investigar la sífilis, los científicos Ludwig Halberstaedter y Stanislaus von Prowazek infectaron orangutanes con rastros conjuntivales de pacientes con tracoma y descubrieron Organismos que llamaron los clamidioszo.
Los dos científicos publicaron la primera etiología de Chlamydia trachomatis en 1907. Según Chlamydiae.com, no fue hasta 1958 que otros científicos descubrieron que el organismo es una bacteria y no un virus.
Según la Revisión de Oftalmología, la clamidia es la enfermedad bacteriana de transmisión sexual más común en el mundo. Las bacterias pueden infectar varias especies animales además de los humanos, y causan dos tipos de infecciones oculares por clamidia en los humanos.