Aunque ambos son marlines, los marlines pertenecen a la familia Istiophoridae, mientras que los peces espada son los únicos miembros de la familia Xiphiidae. Visualmente, la mayor diferencia es que los marlines tienen una cresta en la espalda mientras el pez espada tener una sola aleta dorsal.
Los Marlins también tienen una sola aleta dorsal grande, pero a diferencia del pez espada, la aleta del marlin se estrecha en una cresta baja que corre a lo largo de la mayor parte de la espalda del pez. Hay tres tipos de marlin. Estos son el marlín hacha, el marlín azul y el marlín blanco. Los tres tienen la cresta distintiva, aunque a diferentes alturas.
Otra diferencia visual entre el marlin y el pez espada es que los marlines tienen aletas pélvicas, que se encuentran en la parte inferior del pez cerca de su cabeza. El pez espada no tiene aletas pélvicas. Los Marlins también tienen quillas caudales dobles, mientras que los peces espada tienen uno solo. Las marcas corporales varían, los marlines tienen manchas en las aletas y rayas corporales, dependiendo de la especie, mientras que el pez espada tiende a ser de color sólido.
En el comportamiento, existe cierta evidencia de que el pez espada usa sus billetes en la caza con más frecuencia que los marlines. Los peces espada son más propensos a cortar presas para matarlos, aunque ambas especies dependen más de la velocidad para capturar sus alimentos. Su rango también varía, ya que los marlines viven exclusivamente en el Océano Atlántico, mientras que los peces espada se encuentran en los océanos Atlántico, Pacífico e Índico.