Los sustratos básicos para la tripsina son proteínas de los alimentos, según Worthington Biochemical Corporation. La tripsina es una enzima digestiva secretada por el páncreas. La tripsina separa las proteínas grandes de los alimentos en sus enlaces peptídicos, rompiéndolas en cadenas polipeptídicas más pequeñas.
Durante la digestión, la tripsina se secreta en la sección duodenal del intestino delgado a través del conducto pancreático. Según el RSCB Protein Data Bank, la tripsina actúa principalmente junto a los aminoácidos lisina y arginina en grandes cadenas de proteínas. A lo largo del proceso digestivo, estos segmentos proteicos cortados son activados por enzimas digestivas adicionales, que en última instancia producen aminoácidos individuales. Estos pequeños aminoácidos se absorben a través del revestimiento del intestino delgado y en el torrente sanguíneo.