Los flagelos ayudan a los cuerpos celulares, como los espermatozoides y las bacterias, a moverse a través del líquido. Los flagelos, al igual que los cilios, están compuestos de microtúbulos que están conectados a la membrana plasmática.
Los microtúbulos en un flagelo se agrupan en nueve pares que rodean un par de microtúbulos. El movimiento de los flagelos es el resultado de los microtúbulos que se deslizan uno contra el otro. El filamento, ubicado al final del flagelo, se une al gancho y está compuesto de flagelina. El movimiento del filamento depende del movimiento del motor que está conectado al gancho. El cuerpo o motor basal, que es producido por los centríolos, puede moverse tan rápido como 300 revoluciones por segundo.
En las bacterias, el flagelo permite que el cuerpo bacteriano se mueva hacia arriba o hacia abajo en una línea recta y cambie de dirección. El cuerpo basal que se une al cuerpo celular afecta la disposición de la estructura del filamento. El filamento tiene forma helicoidal, pero las proteínas de la flagelina se reorganizan si se aplica o elimina el torque del motor. Algunos cuerpos celulares con flagelos son capaces de moverse a través del tejido, creando problemas para la linfa o el sistema circulatorio. Los flagelos a menudo se encuentran solos o en pequeñas cantidades, mientras que muchos cilios se encuentran juntos.
