Las moscas de la fruta están entre los miembros más pequeños de los Dípteros de la Orden y tienen ojos grandes y pronunciados, cuerpos ovalados y un juego de cuatro alas, muy parecidas a las moscas más grandes. de largo, y las hembras son ligeramente más grandes que los machos. Se parecen mucho a muchas especies de moscas en apariencia, comparten la misma forma única del cuerpo, alas grandes y ojos saltones, pero tienen varias diferencias biológicas clave.
Las moscas de la fruta están separadas biológicamente de sus parientes más cercanos por sus pectinadas aristas, que son pequeñas estructuras similares a pelos que cubren sus antenas. Las moscas de la fruta baten sus alas más rápido y agresivamente en vuelo que sus primos más grandes, lo que les proporciona un zumbido distintivo y agudo mientras vuelan por el aire que la mayoría de las otras moscas. Como con otros en la Orden Diptera, las moscas de la fruta varían en color dependiendo de la especie. Algunos son vibrantes y vívidos y tienen cuerpos y alas coloreadas en naranja brillante, carmesí y dorado, mientras que otros son azul oscuro, gris y negro. Las moscas de la fruta tienen antenas largas, que pueden ser el doble del tamaño de la longitud de su cuerpo. Estas antenas están equipadas con pequeños sensores al final que guían a las moscas a sus suministros de alimentos. Las moscas de la fruta tienen ojos compuestos de gran tamaño, como la mayoría de los insectos, que esencialmente les dan una visión 3D.