Dos organismos son parte de la misma especie si son capaces de cruzarse. Dos organismos que se ven similares pero no pueden reproducirse juntos en realidad no son la misma especie. Por ejemplo, los picos del este y el oeste parecen casi idénticos pero son incapaces de cruzarse; Por lo tanto, son dos especies diferentes.
La definición de cruzamiento de especies se conoce como el concepto de especie biológica en la ciencia. Hay algunos organismos que se ven muy diferentes pero siguen siendo las mismas especies. Las hormigas Pheidole barbata pueden verse diferentes debido a sus roles dentro de la colonia, pero aún son capaces de cruzarse como una especie.
Algunas situaciones en la naturaleza plantean dificultades para el concepto de especie biológica, como los organismos asexuales y los organismos que ocasionalmente producen híbridos. La definición también plantea problemas para ciertas plantas ampliamente apareadas como las orquídeas. Ciertas especies de orquídeas son capaces de cruzarse con un gran número de plantas no orquídeas, borrando la distinción entre especies.
Aunque el concepto de especie biológica es la visión más destacada de la ciencia a partir de 2015, otras definiciones de especies siguen siendo aplicables en ciertos casos. El concepto de especie morfológica, por ejemplo, se utiliza en paleontología para definir las especies prehistóricas solo por su apariencia. Debido a que las parejas reproductoras de un organismo extinto son desconocidas, la apariencia es la única forma de clasificar las especies de este período. Un problema potencial con el concepto de morfología de especies es la asignación accidental de diferentes especies a organismos masculinos y femeninos que, en realidad, son capaces de cruzarse, debido a la falta de información.