Louis Pasteur finalmente refutó la generación espontánea a través de un experimento en el que el caldo de res se esterilizó mediante ebullición en dos matraces, uno que estaba expuesto al aire y otro que estaba protegido de él. los contaminantes se nublaron, mostrando un crecimiento microbiano, mientras que el sellado no lo hizo.
Louis Pasteur es famoso por sus contribuciones a la comprensión de las enfermedades y los microbios en general. El proceso de pasteurización, donde se tratan la leche, el vino y otros consumibles para detener la contaminación bacteriana, fue descubierto y nombrado por él. Pasteur fue el primero en demostrar que la fermentación es causada por microorganismos y que no se requiere oxígeno para este proceso.
Pasteur no originó la teoría de los gérmenes, pero fue él quien proporcionó suficiente evidencia experimental para convencer a la mayoría de la comunidad científica de que era verdad. También fue el primero en declarar los principios de la vacunación, y creó las primeras vacunas para la rabia y el ántrax. Descubrió estos principios después de un contratiempo mientras estudiaba el cólera del pollo, normalmente una enfermedad mortal. Trató a los pollos con un cultivo bacteriano que se había echado a perder, que solo produjo síntomas leves. Después, no pudo volver a infectar a los pollos, incluso con bacterias viables.