Los buenos nucleófilos incluyen RO-, -NH2, Cl-, Br-, I-, F-, CN-, -OH y RCO2-. Existen tanto nucleófilos con carga negativa como neutrales. Los nucleófilos con carga negativa son mejores que los neutros y dan como resultado velocidades de reacción más rápidas. Algunos nucleófilos neutros incluyen H2O, NH3, ROH y RCOOH.
Los nucleófilos deben ser buenas bases de Lewis, lo que significa que tienen electrones para compartir con otros átomos. El mismo átomo reactivo puede tener carga neutra o negativa, dependiendo del nucleófilo. El oxígeno es neutro en H2O pero cargado negativamente en -OH. La nucleofilia y la basicidad aumentan de derecha a izquierda en la tabla periódica. A medida que aumenta la electronegatividad, la nucleofilicidad disminuye.