Zacharias Janssen inventó el primer microscopio compuesto. Zacharias y su padre, Hans, originalmente fabricaron lentes o anteojos, pero Hans Janssen pudo haber contribuido a la invención de su hijo. Aunque los primeros microscopios que hizo Janssen eran crudos para los estándares modernos, llevaron al desarrollo de mejores instrumentos científicos.
Los primeros microscopios compuestos desarrollados por Zacharias Janssen en la década de 1590 fueron enormes en comparación con las versiones actuales. El trípode mide más de dos pies de altura. El instrumento real era un tubo equipado con dos lentes, una lente convexa en un extremo y una cóncava en el otro. Una lente dobló la luz; el otro amplió la imagen.
Los primeros microscopios solo aumentaron las imágenes entre tres y nueve veces el tamaño del objeto real. Transcurriría más de medio siglo antes de que el microscopio compuesto se usara ampliamente en la comunidad científica.
