Una cadena larga de muchos aminoácidos se llama polipéptido. Un polipéptido tiene cientos o incluso miles de aminoácidos unidos entre sí, mientras que un péptido es una cadena más pequeña de aminoácidos. Como su nombre indica, los polipéptidos están compuestos de múltiples péptidos.
Una cadena larga de aminoácidos puede o no ser considerada una proteína también. En general, la cadena básica de ácidos se considera un polipéptido hasta que toma su forma tridimensional final, que es funcional. Además, ciertas proteínas están compuestas por ambos polipéptidos y otros grupos moleculares llamados cofactores o grupos protésicos. Las proteínas son responsables de una amplia gama de tareas biológicas en la mayoría de los organismos vivos.