El cocodrilo americano, conocido por los científicos como Alligator mississippiensis, está en la cima de la cadena alimentaria. Llamado un depredador apical, los adultos de caimanes estadounidenses se alimentan de prácticamente todas las criaturas que comparten su hábitat, pero no temen a nada, excepto a los humanos y caimanes más grandes. Sin embargo, sus crías no son tan seguras, y muchos caimanes son consumidos por una variedad de depredadores acuáticos.
Los peces y las tortugas son la presa más importante para la mayoría de los caimanes, pero no son comedores quisquillosos. Otras especies de presa comunes incluyen serpientes, ranas, sapos, salamandras, aves, lagartos, castores, mapaches, nutria, ratas, crustáceos, moluscos, insectos y caimanes pequeños. Los caimanes jóvenes se alimentan de presas más pequeñas, incluyendo insectos, ranas y peces. Los caimanes de todas las edades se adaptan a las fuentes de alimentos locales, pero son estrictamente carnívoros y no comen vegetación.
Aves zancudas, serpientes, peces grandes, tortugas, mapaches, zorros y caimanes más grandes cazan caimanes jóvenes. A medida que crecen, los caimanes jóvenes agregan más y más grandes presas a su lista de alimentos aceptables. Al mismo tiempo, los caimanes temen a menos depredadores a medida que crecen.
Los caimanes son una parte importante de los ecosistemas de agua dulce, ya que ayudan a mantener el equilibrio entre las poblaciones de animales pequeños. Además, las tortugas y algunos otros animales depositan sus huevos en nidos de cocodrilos.