Las células eucariotas tienen un núcleo, y sus orgánulos están encerrados dentro de las membranas. También tienen una membrana plasmática, que es una capa de fosfolípidos que rodea toda la célula, y cuentan con un citoesqueleto interno .
En comparación con las células procariotas, las células eucariotas son al menos 10 veces más grandes. Su citoplasma se compone tanto de ribosomas como de cistol. Protegidos por su membrana plasmática, también tienen protecciones para cada orgánulo en forma de membranas individuales. La membrana plasmática es el sitio para las funciones de señalización y transporte de toda la célula.
Dentro de las células eucariotas, el sistema endomembrana es una red de membranas que comparten materiales. Los lisosomas, el retículo endoplásmico y el aparato de Golgi forman parte de este sistema más grande. Las células eucariotas también tienen una matriz extracelular formada por glicoproteínas y proteínas que otras células han secretado. Esta matriz se encuentra alrededor de muchas células animales diferentes.
Las células eucariotas se mueven por la función de flagelos o cilios, dependiendo del tipo de eucariota. Los flagelos son colas en un extremo de la celda que se mueven de un lado a otro, impulsando la celda en una dirección. Los cilios son más cortos y más numerosos, y todos baten en concierto para conducir la celda en una dirección particular.