Las colonias de levadura son más grandes que las colonias de bacterias porque las células de levadura individuales son considerablemente más grandes que las células bacterianas. Tanto la levadura como las bacterias son microorganismos unicelulares, pero las levaduras son eucariotas y las bacterias son procariotas. Una célula eucariota contiene un núcleo y orgánulos estructurales encerrados dentro de una doble membrana. Las levaduras también tienen paredes celulares gruesas que encapsulan el organismo. Los procariotas, como las bacterias, son más pequeños porque carecen de un núcleo y de orgánulos unidos a la membrana.
Las células de levadura aumentan en número asexualmente por la brotación. Como lo explicó Gary Kaiser en el Community College del condado de Baltimore, se forma una yema en la superficie externa de una célula madre y el núcleo de la célula se divide. Uno de los núcleos divididos entra en la yema de formación, y el material de la pared celular se produce entre la célula madre y la yema. El capullo se rompe para convertirse en una nueva célula hija. Esta multiplicación de células de levadura genéticamente idénticas se puebla en una colonia. Las bacterias dividen y pueblan colonias a través de la fisión binaria, otra forma de reproducción asexual. El ADN circular de la bacteria se replica, y las copias se separan en los extremos opuestos de la célula. La pared celular de la bacteria crece, formando una hendidura en el centro de la célula. La hendidura eventualmente pellizca la célula divisoria en dos células hijas separadas pero idénticas. La fisión binaria continúa dentro de cada célula hija, poblando la colonia bacteriana.
