Los lémures están en peligro debido a la destrucción de su hábitat en el bosque tropical. Otra causa es la tala acelerada causada por el aumento de la pobreza como resultado de la agitación política en las regiones donde vive el lemur. La caza también representa un riesgo para la población lémur.
De las 103 especies conocidas de lemur, 91 por ciento están amenazadas. Esto llevó a que el lémur de Madagascar fuera apodado como el más cercano a estar al borde de la extinción por la Comisión de Supervivencia de Especies de la Unión Internacional para la Conservación de la Naturaleza. Un total de 23 especies están en peligro crítico a partir de 2015, cincuenta y dos están en peligro y 19 están clasificadas como vulnerables. Los lémures son los más amenazados de cualquier grupo de vertebrados.