Los aye-ayes están en peligro de extinción principalmente debido a la destrucción del hábitat, ya que los humanos han invadido rápidamente sus hábitats. También son asesinados frecuentemente por los malgaches nativos que los ven como plagas de cultivos y malos presagios. Los aye-ayes a veces habitan plantaciones de coco y lichi.
Los aye-ayes están muy extendidos en la isla de Madagascar en una variedad de entornos. Viven en selvas tropicales, bosques caducifolios, bosques secos de matorral y bosques de manglares. Tienen requerimientos calóricos relativamente altos y consumen frutas, nueces, fluidos de plantas y larvas de insectos para mantenerse. Los alimentos vegetales que se consumen incluyen mangos, frutas del pan, plátanos, cocos, néctar del árbol del viajero y bambú.
Los aye-ayes cazan larvas perforadoras de madera utilizando forrajeo por percusión; tocan la corteza de un árbol para escuchar los espacios huecos dejados por las larvas. Hacen tapping con sus terceros dedos especializados, que son extremadamente largos, delgados y flexibles. Una vez que encuentran una cavidad, la desgarran con sus incisivos agrandados. Utilizan sus terceros dedos especializados una vez más para pescar cualquier gusano.
Sus dedos largos son delicados, por lo que los aye-ayes deben tener especial cuidado al moverse para evitar dañarlos. Se doblan los dedos y distribuyen más estrés en sus cuartos traseros que muchos primates trepadores para este propósito. A pesar de esto, son escaladores extremadamente adeptos, capaces de saltar a través de los árboles y descender de los árboles de cabeza.