Los hombres poseen genitales externos (pene, escroto y testículos) para la producción y distribución de esperma, y las mujeres poseen genitales internos (vagina, útero y ovarios) para la producción de óvulos y el desarrollo de embriones humanos. La mayoría de las diferencias fisiológicas entre hombres y mujeres se producen debido a diferencias en los sistemas endocrinos durante períodos críticos de desarrollo, como el crecimiento fetal y la pubertad.
Las funciones de los sistemas endocrinos en hombres y mujeres llevan a otras diferencias fisiológicas a lo largo de la vida. Por ejemplo, los hombres producen un curso más amplio y un tipo visible de folículo piloso llamado pelos terminales en el pecho, abdomen, cara y espalda. Las mujeres, sin embargo, producen un folículo piloso más fino llamado vellosidades en menos áreas del cuerpo. La producción de hormonas en el sistema endocrino también es parcialmente responsable del desarrollo y las diferencias de calvicie de patrón en hombres y mujeres.
Grandes diferencias también están presentes en los sistemas esquelético y muscular en hombres y mujeres. Típicamente, los hombres poseen tendones, ligamentos y huesos más densos y fuertes que las mujeres, y los hombres generalmente tienen más masa muscular. Esto conduce a diferencias en la fuerza física y los procesos metabólicos del gasto y almacenamiento de calorías. En comparación, las mujeres suelen tener un sistema esquelético que es menos robusto y de estructura más suave que el que se encuentra en los hombres.