Los principales cuerpos de agua en Missouri incluyen el río Missouri, el río Mississippi, el Lago de los Ozarks, el río Current, el río Chariton y el Lago Taneycomo. Otros cuerpos de agua notables son el lago Pomme de Terre y el lago Table Rock.
El río Mississippi es el río más largo de los Estados Unidos. Forma el límite de Missouri con Illinois, Kentucky, Tennessee y una franja de Iowa. El río ha facilitado el transporte y ha suministrado agua y energía hidroeléctrica a los residentes de Missouri durante muchas décadas.
El río Missouri es el segundo río más largo de los Estados Unidos. Cruza el estado en dirección oeste-este y se une al río Mississippi en St. Louis. El Missouri, apodado el "Big Muddy" debido a su agua turbia, ha sido una vía para los exploradores y pioneros durante cientos de años. Las ramas del Misuri incluyen los ríos Cheyenne, Osage, Platte, Milk y White. Se vacía en el Golfo de México a través del Mississippi.
El Lago de los Ozarks es un lago artificial creado a través de la represa del río Osage. El embalse no solo alberga la presa de Bagnell, que proporciona energía hidroeléctrica, sino que también es un área recreativa famosa que atrae el turismo.
