Las Filipinas tienen varios cuerpos de agua. Estos incluyen ríos, bahías, golfos, cascadas, lagos y pantanos. Las Filipinas están formadas por islas; como resultado, si todos los cuerpos de agua estuvieran alineados de extremo a extremo, medirían 17.500 kilómetros de longitud.
La bahía de Manila es un puerto natural ubicado en Filipinas, cerca de la ciudad capital de Manila. El puerto es un puerto clave para el comercio entre Filipinas y el resto del mundo.
Los tres ríos más grandes del país son el río Cagayan, Rio Grande de Mindanao y el río Agusan. El río Cagayan se encuentra en la parte norte de la isla de Luzón. El río Grande de Mindanao y el río Agusan se encuentran en la isla de Mindanao. El río subterráneo en la isla de Palawan es popular entre los turistas.
Las cataratas de María Cristina son las cascadas más grandes de Filipinas. Ubicadas en el río Agus, las cataratas María Cristina son otro destino turístico popular. Las caídas se conocen como las "caídas gemelas" porque el flujo del río está separado por una roca situada poco antes de las caídas. La cascada de 320 pies de altura es la principal fuente de energía hidroeléctrica para las industrias ubicadas en la ciudad de Iligan.