Hay tres formas de diferenciar entre canarios masculinos y femeninos: inspección genital, apariencia del color y canción temprana. El criador Sebastian Vallelunga considera que la inspección de un canario sexualmente maduro es un método prácticamente infalible, ya que el macho tiene un pseudo-pene que sobresale de su ventilación, mientras que una hembra tiene una cúpula redonda que sobresale por encima de la ventilación. Las hembras listas para reproducirse tienen un vientre uniforme en forma de torpedo que se estrecha en un extremo.
La indicación más obvia y confiable del género es si el canario pone un huevo o no. Algunos criadores prefieren separar los sexos temprano para promover un mejor desarrollo de la canción entre los machos, incluso antes de que los polluelos se separen. Examinar la canción inicial y el análisis basado en el color son herramientas útiles.
La canción temprana del canario, conocida como sub-canción, es un trino de ensueño durante el cual se infla la garganta del macho, reflejando el comportamiento adulto posterior. Durante la siguiente fase de aprendizaje de canciones, una canción plástica, el hombre comienza a integrar pasajes y frases de adultos en su canción, lo que lo convierte en un indicador de género más confiable.
La apariencia del color es un método menos consistente con variaciones entre las especies que se aplican mejor a los canarios que están estrechamente relacionados o pertenecen a la misma cepa. En general, Vallelunga cree que el canario más pálido es una mujer.