La HPLC, cromatografía líquida de alto rendimiento, tiene muy pocas desventajas, pero esas pocas son de baja sensibilidad, dificultad para limpiar y los dispositivos son muy caros. La función, el uso y la precisión de un dispositivo de HPLC es muy similar a un GC o cromatografía de gases.
Las muestras utilizadas en una máquina de cromatografía líquida de alto rendimiento suelen ser más grandes que las de una máquina de cromatografía de gases. A pesar de la cantidad de desventajas que tiene, también hay numerosas ventajas. Los dispositivos son más precisos que otros y pueden analizar una gama más amplia de compuestos, aunque el dispositivo GC puede funcionar mejor con mezclas más complejas que los dispositivos HPLC.
