Los indios cherokee tienen rasgos faciales similares a los de otros indios americanos, que incluyen pómulos altos, ojos en forma de almendra, párpados gruesos, dientes frontales grandes, orejas gruesas y piel de bronce. Sin embargo, no todos Los cherokees poseen estas características físicas, debido al contacto temprano con los mineros escoceses y alemanes en el sureste.
Algunos cherokees pueden ser rubios, de ojos azules y de piel clara. Los hombres cherokees suelen tener entre 5 pies y 4 pulgadas y 5 pies y 5 pulgadas de alto, y las mujeres suelen ser menos de 6 pulgadas más cortas. Curiosamente, los cherokees pueden obtener algunas de sus características físicas de los pueblos de Oriente Medio, ya que su ADN tiene similitudes con las de los egipcios, turcos, libaneses, hebreos y mesopotámicos.