Algunos ejemplos de organismos dentro del dominio de las eubacterias son algas, E. coli y salmonela. También conocidas como bacterias verdaderas, son organismos microscópicos, procarióticos, unicelulares sin núcleo que producen su alimento por fotosíntesis.
Aunque algunas eubacterias son dañinas para los humanos, y todos los patógenos bacterianos conocidos son eubacterias, también pueden ser útiles. Las eubacterias se utilizan en la producción de vinos, quesos y yogures y también forman parte del proceso utilizado en las plantas de tratamiento de aguas residuales. Estos organismos han existido por más de 3 mil millones de años y, como resultado del oxígeno producido por su proceso de fotosíntesis, hicieron posible que sobrevivieran los animales que respiran aire.