Hay varios depredadores del caballito de mar, incluyendo el cangrejo, la raya, el atún y el pingüino. Los caballitos de mar no tienen un mecanismo de defensa natural y no nadan muy bien, dos factores que los dejan abiertos. Depredar y depender de su entorno para su protección.
El tamaño del caballito de mar es una cosa que ayuda a protegerlo porque incluso el caballito de mar más grande mide solo 8 pulgadas de altura, y el caballito de mar puede cambiar los colores según su entorno, por lo que puede esconderse de los depredadores. Aún así, es muy susceptible a ser comido por otras criaturas en el mar. Aunque un caballito de mar puede dar a luz a 1.500 caballitos de mar o más a la vez en embarazos que duran de 10 a 25 días, solo el 1 por ciento de los bebés sobreviven.