Una hembra de pato Muscovy es considerablemente más pequeña que un macho y tiene menos caruncles en su cara o en la base de su factura. Las carúnculas son los bultos carnosos, rojos y verrugosos que se encuentran principalmente en los machos.
Las plumas en los patos Muscovy macho son generalmente más brillantes, con las plumas negras que muestran un tinte púrpura o verde. Las plumas femeninas son de color más gris. Mientras que los patos Muscovy no gritan como otros patos, los machos silban cuando están amenazados, y las hembras verbalizan con un suave cluck o churr (un sonido agudo de zumbido). Los machos tienen patas más gruesas y pies más grandes que las hembras.
