Los huracanes pueden devastar los ecosistemas boscosos y eliminar toda la foliación de las copas de los bosques, y pueden cambiar los hábitats de manera tan drástica que las poblaciones de animales autóctonas sufren como resultado. Especies en peligro de extinción en hábitats tropicales, estuarinos y costeros están particularmente en riesgo cuando los huracanes golpean.
Los vientos de los huracanes producen el impacto ambiental más visible. Volar sobre una selva tropical después de un huracán a menudo revela que la capa del dosel ha desaparecido por completo, lo que afecta la vida de las aves y los animales que anteriormente habían usado el área directamente debajo de ese dosel como su hábitat. Las áreas boscosas, como pantanos y pantanos, sufren una destrucción significativa a medida que los vientos arrancan y demuelen árboles.
Las mareas de tormenta y las lluvias abundantes se combinan con los fuertes vientos para amenazar el suministro de alimentos disponible para los animales que quedan sin ser asesinados por la tormenta. Cuando el huracán Hugo golpeó a Puerto Rico en 1989, la mitad de los loros puertorriqueños que quedaban en el mundo murieron en la tormenta. El Cozumel Thrasher, que solo vive en la isla mexicana de Cozumel, casi se extinguió después de que el huracán Gilbert azotara la isla en 1988.
Los huracanes también cambian la forma de los paisajes costeros al desplazar enormes cantidades de arena. Los huracanes en 2004, 2005 y 2008 causaron grandes cambios en la costa del Golfo de México; entre los huracanes Katrina y Rita, que afectaron en 2005, se perdieron cerca de 73 millas cuadradas de tierra en el mar.
