El pastor John Hagee se divorció de su primera esposa, Martha, en 1975. Los dos habían estado casados durante 15 años y tuvieron dos hijos: un hijo llamado Christopher y una hija llamada Tish.
El pastor de la Iglesia Cornerstone se casó con su segunda esposa, Diana, aproximadamente un año después. Tiene tres hijos con su esposa Diana, Matthew, Christina y Sandy, además de ocho nietos, a partir de 2014. Matthew se convirtió en pastor ejecutivo de la iglesia de su padre.
Además de ser el pastor de una gran iglesia sin denominación, Hagee también ha escrito varios libros y, a menudo, viaja con su familia como parte de un grupo de canto.
