Entre los aliados de Atenea había muchos héroes de la mitología griega, incluidos Odiseo, Jason, Perseo y Heracles. Debido a que se puso del lado de los griegos en la guerra de Troya, sus enemigos incluían a París y los otros defensores de Troya. Entre los dioses, sus oponentes incluían a Hefesto y Poseidón.
Según la mitología griega, Atenea ayudó a Jason a adquirir el vellón de oro. También ayudó a Perseo a decapitar a Medusa. Ella le aconsejó a Heracles que usara las propias garras del león de Nemea para cortar su piel inexpugnable, le dio un sonajero para asustar a los pájaros de Stymphalian para que pudiera matarlos y lo ayudó a entrar en el inframundo para derrotar a Cerberus. Atenea ofreció consejo a Odiseo durante la Guerra de Troya, lo protegió en sus andanzas, lo guió a su casa y lo ayudó a recuperar su hogar y su esposa.
Un mito griego dice que Afrodita, Hera y Atenea decían ser la diosa más bella, y Zeus nombró a París, un príncipe troyano, para que decidiera entre ellos. París eligió a Afrodita sobre Atenea, y esto hizo que Atenea favoreciera al bando griego en la guerra de Troya. Aunque tanto Ares como Atenea eran representantes de la guerra, simbolizaba la sabiduría, la perspicacia, el coraje, la gloria y la superioridad moral más que el miedo y la sed de sangre. Aunque se reconoce que Atenea es una diosa virgen, se convirtió en madre. Hefesto, el hijo de Zeus y Hera, trató de violarla, y cuando su semilla cayó de su pierna a la tierra, nació Erichthonius, mitad serpiente y mitad hombre. Poseidón se convirtió en el oponente de Atenea debido a una discusión sobre quién sería el patrón de Atenas. En su competencia, cada uno ofreció regalos a los atenienses. Poseidón les ofreció a los atenienses una fuente de agua salada, pero Atenea ganó ofreciéndoles un olivo.