A partir de 2015, Bill O'Reilly no está casado, pero estuvo casado con Maureen McPhilmy de 1996 a 2011. La pareja se reunió en 1992, se casó el 2 de noviembre de 1996, se separó en 2010. y se divorció oficialmente en 2011. La pareja tiene dos hijos, Madeline y Spencer.
En 2015, McPhilmy acusó a O'Reilly de abusar físicamente de ella. Aproximadamente un año antes de su separación, la hija de la pareja vio a O'Reilly agarrar a McPhilmy por el cuello y arrastrarla por una escalera. O'Reilly ha negado las acusaciones y ha expresado abiertamente la violencia doméstica en varias ocasiones en su programa "The O'Reilly Factor".