Muchos botánicos utilizan herramientas como lupas, cámaras, dispositivos GPS, guías de campo y computadoras. Además, un simple cuaderno y un lápiz son herramientas invaluables que permiten a los biólogos de campo registrar sus observaciones. Los botánicos utilizan una variedad de herramientas diferentes, dependiendo de su especialidad y la tarea específica que están tratando de realizar.
Algunos botánicos trabajan en laboratorios con herramientas y equipos altamente avanzados. Por ejemplo, los botánicos que intentan investigar el ADN o la estructura microscópica de una planta pueden necesitar microscopios y otros equipos de laboratorio de alta tecnología. Otros botánicos trabajan en invernaderos, estudiando los hábitos de crecimiento y los requerimientos de nutrientes de las plantas. Dichos científicos deben usar higrómetros, kits de análisis de suelos y otros dispositivos de medición. Los botánicos con orientación académica, especialmente aquellos que se concentran en estudiar taxonomía o sistemática, pasan la mayor parte de su tiempo usando computadoras y consultando libros para completar su trabajo.
Los botánicos utilizan podadoras, cizallas y cortadoras, con una variedad de especialidades, especialmente entre aquellos que trabajan en el campo. Algunos botánicos usan una herramienta llamada hori-hori para desenterrar las raíces de pequeñas plantas herbáceas. Los contenedores y las bolsas de recolección son útiles para transportar muestras al laboratorio para un análisis más detallado. Las prensas para plantas también son herramientas útiles que permiten a los botánicos preservar las hojas para futuros estudios.