Las enzimas que se producen en el cuerpo generalmente rompen los enlaces de largas cadenas peptídicas y las convierten en cadenas más pequeñas. Las cadenas peptídicas grandes son demasiado grandes para ser absorbidas a través del intestino delgado, donde tiene lugar gran parte de la digestión.
Cada proteasa corta los enlaces en un cierto punto de la cadena peptídica y cada uno funciona mejor a un determinado pH. Por ejemplo, la quimotripsina hace su mejor trabajo a pH 8, que es ligeramente alcalino. La pepsina funciona mejor a pH 2, que es extremadamente ácido. Esto se debe a que las células del estómago liberan la pepsina, donde los alimentos se procesan en un baño de enzimas y ácido clorhídrico. Sin embargo, la tripsina y la quimotripsina se producen en el páncreas y se secretan en el intestino delgado.
La bromelina se encuentra en la fruta y el tallo de la piña. Bromelian y papain se utilizan como ablandadores de carne y como suplementos para tratar afecciones médicas como lesiones deportivas y heridas.