Los niveles de agua fluctuantes dependen de la cantidad de agua que entra y sale de un cuerpo de agua. Los niveles de agua aumentan cuando hay más precipitación y condiciones más frescas y nubladas que causan menos evaporación. Menos precipitaciones y temperaturas más cálidas dan como resultado niveles de agua más bajos.
Las fluctuaciones del nivel de agua pueden ser a corto plazo, a largo plazo o estacionales. Las fluctuaciones a corto plazo pueden ser causadas por cambios en la presión barométrica o tormentas. Estos cambios pueden durar desde unas pocas horas hasta unos pocos días. Las fluctuaciones a largo plazo, por otro lado, requieren años de cambios en las condiciones de precipitación y temperatura para hacer que los niveles de agua suban y bajen.
Las fluctuaciones estacionales del agua corresponden al cambio de estaciones. Las estaciones cálidas, como la primavera y el verano, hacen que entre más agua y que se evapore menos. Lo contrario es cierto para las estaciones más frías cuando los niveles de agua disminuyen.